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La cromatografía de intercambio iónico (o cromatografía iónica) es un proceso que permite la separación de iones y moléculas polares basado en las propiedades de carga de las moléculas. Puede ser usada en casi cualquier tipo de molécula cargada, incluyendo proteínas grandes y nucleótidos y aminoácidos pequeños. La solución que debe inyectarse normalmente se denomina "muestra", y los componentes separados individualmente se llaman analitos. Se emplea a menudo en purificación de proteínas, análisis del agua o control de calidad.
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