La Eliminatoria para el Campeonato Sub-16 de la AFC de 2020 fue la fase previa que disputaron 47 selecciones sub-17 de la Confederación Asiática de Fútbol para definir a los 16 participantes en la fase final del torneo a celebrarse en Baréin, quien clasificó automáticamente para la fase final por ser el país anfitrión. La eliminatoria se jugó del 14 al 22 de septiembre de 2019 y contó con 11 grupos eliminatorios en 11 sedes diferentes.